La fluorescéine et ses dérivés peuvent être responsables de réactions d'hypersensibilité immédiate par voie topique et intraveineuse (urticaires de contact, rarement des chocs anaphylactiques par voie IV voire par voie topique), mais aussi de réactions d'hypersensibilité retardée, par voie topique, à la tétrabromofluorescéine ou éosine (eczémas de contact).